Projets AQUAQUAL et AQUAPROVI : Caractérisation des populations bactériennes, virales et protozoaires présents dans les eaux de captage de surface en Région wallonne pour une optimalisation de la gestion de la qualité microbiologique des eaux (validation de méthode de séquençage à haut débit NGS multi-cibles)
Description de la recherche
La thématique générale du programme de recherche AQUAQUAL et AQUAPROVI est l’optimalisation de la gestion de la qualité microbiologique des eaux, c’est-à-dire améliorer la détection et l’identification de bactéries, virus et protozoaires potentiellement présents dans les eaux de distribution et de captage.
Dans le cadre de ces deux projets, la recherche menée par le laboratoire de biotechnologie et biologie appliquée de la HEPH-Condorcet est divisé en différentes tâches :
- La collecte des échantillons d’eau brute (volume de 50L),
- La filtration/concentration des échantillons d’eau via une technique de filtration à flux tangentiel
- L’extraction des acides nucléiques totaux (ADN et/ou ARN) des échantillons filtrés et concentrés,
- La caractérisation des microorganismes (bactéries, virus et protozoaires) présents dans les échantillons d’eau par des techniques de biologie moléculaire (PCR, PCR en temps réel et séquençage par la méthode de Sanger),
- L’analyse des résultats obtenus: étude de la diversité génétique des microorganismes présents dans les eaux analysées afin de les comparer avec les résultats du séquençage haut débit réalisé par le partenaire.
Suite à la réalisation de ce projet de recherche, la société partenaire dispose d’une méthode de séquençage à haut débit de dernière génération et l’équipe de recherche du laboratoire de biotechnologie et biologie appliquée a acquis une expérience dans les domaines précités.
Promoteurs
GADENNE Martine- martine.gadenne@condorcet.be & LANTERBECQ Deborah – deborah.lanterbecq@condorcet.be
Mots-clés : Microorganismes, séquençage, biologie moléculaire, eau de captage, filtration à flux tangentiel